Das ist alles ganz normal.
Wenn Du ein Plugin via Instrumentspur einbindest, dann ist es eben an diese gekoppelt.
Warum generischer Controller? Das dient dazu einen Controller in Cubase einzubinden - ganz unabhängig von irgendeinem Instrument-Plugin.
Also: GAO über das Instrumente-Rack laden. Am Controller den Reglern die entsprechenden Werte zuweisen um die Parameter des GAO anzusteuern.